La phyllosphère, c'est-à-dire la partie aérienne des plantes, abrite des communautés bactériennes diversifiées qui jouent un rôle écologique et bénéfique important pour les plantes. Cependant, des groupes majeurs comme les Hyphomicrobiales (Alphaprotéobactéries) restent mal caractérisés en raison des limites du métabarcoding basé sur l'ARNr 16S et des biais présents dans les bases de données. Dans notre laboratoire, nous utilisons la métagénomique et la culture à large échelle pour mieux représenter ces bactéries associées aux feuilles dans les bases de données et pour élucider les mécanismes évolutifs et fonctionnels qui sous-tendent leur adaptation aux plantes.